Если вы арендовали сервер для публикации вашего сайта или приложения вне зависимости от того физический он (bare-metal server) или виртуальный (Virtual Dedicated Server, VDS) настоятельно не рекомендуется подключаться к нему и работать с ним под супер-пользователем root, который имеет неограниченные права. Правильнее будет создать нового пользователя и работать под ним. Также следует отказаться от подключения к серверу через ssh по паролю в пользу аутентификации с помощью ключа.